BLAST - bu kompyuter algoritmi boʻlib, undan Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) veb-saytida va boshqa koʻplab saytlarda foydalanish mumkin. BLAST soʻrovi DNK ketma-ketligini ketma-ketliklar maʼlumotlar bazasi bilan tezda moslashtirishi va solishtirishi mumkin, bu esa uni davom etayotgan genomik tadqiqotlarda muhim vositaga aylantiradi.
BLAST asosiy maʼlumotlar bazasimi?
BLAST bioinformatika tadqiqotlarida eng koʻp qoʻllaniladigan dastur hisoblanadi. Uning asosiy vazifasi qiziqishlar ketma-ketligini, soʻrovlar ketma-ketligini katta maʼlumotlar bazasidagi ketma-ketliklar bilan solishtirishdir BLAST soʻng maʼlumotlar bazasida topilgan eng yaxshi moslik yoki “xitlar” haqida hisobot beradi. Bu oddiy dastur ikkita asosiy ilovaga ega.
NCBI ma'lumotlar bazasimi?
NCBIda biotexnologiya va biotibbiyotga oid bir qator ma'lumotlar bazalari mavjud va bioinformatika vositalari va xizmatlari uchun muhim manba hisoblanadi. Asosiy ma'lumotlar bazalariga DNK ketma-ketligi uchun GenBank va biotibbiy adabiyotlar uchun bibliografik ma'lumotlar bazasi PubMed kiradi. Boshqa maʼlumotlar bazalariga NCBI Epigenomics maʼlumotlar bazasi kiradi.
BLAST faqat NCBI ma'lumotlar bazalarida qo'llaniladimi?
BLAST internetda NCBI veb-saytidamavjud. Soʻrovlar ketma-ketligi va maqsadli maʼlumotlar bazalariga koʻra har xil turdagi BLASTlar mavjud.
BLAST ma'lumotlar bazasi qanday ishlaydi?
BLAST qanday ishlaydi? BLAST homolog ketma-ketliklarni evristik usul yordamida aniqlaydi dastlab ikkita ketma-ketlik orasidagi qisqa mosliklarni topadi; shunday qilib, usul butun ketma-ketlik maydonini hisobga olmaydi. Dastlabki oʻyindan soʻng, BLAST ushbu dastlabki moslashuvlardan mahalliy moslashishni boshlashga harakat qiladi.
