Logo uz.boatexistence.com

Nega bir nechta ketma-ketlikni tekislash kerak?

Mundarija:

Nega bir nechta ketma-ketlikni tekislash kerak?
Nega bir nechta ketma-ketlikni tekislash kerak?
Anonim

Bir nechta ketma-ketlik moslamalari ikki-chiziq tekislashdan ko'ra ko'proq ma'lumot beradi, chunki ular proteinlar oilasi tarkibida tarkibiy va funktsional ahamiyatga ega bo'lgan saqlangan hududlarni ko'rsatadi.

Bir nechta ketma-ketlikni moslashtirishdan maqsad nima?

Biologik ketma-ketliklar toʻplamini (RNK, oqsillar, DNK) hisobga olgan holda, MSA usulining maqsadi ketmalarni ularning evolyutsion, funktsional yoki strukturaviy munosabatlarini aks ettiradigan tarzda tekislashdan iborat(1-rasm).

Bir nechta ketma-ketlikni tekislash evolyutsiyada qanday yordam beradi?

Tegislangan ketma-ketliklar koʻp maqsadlarda qoʻllaniladi, jumladan divergensiya naqshlarini baholash, tanlash, evolyutsion oʻzgarish tempi va usuli, funksional elementlar va cheklovlarni aniqlash va filogenetik tarix, bir nechtasini nomlash uchun.

Bir nechta ketma-ketlikni tekislashmi?

Multipple Sequence Alignment (MSA) - odatda oʻxshash uzunlikdagi uch yoki undan ortiq biologik ketma-ketlikning (oqsil yoki nuklein kislota) hizalanishi Chiqarishdan homologiyani aniqlash mumkin va o'rganilayotgan ketma-ketliklar orasidagi evolyutsion munosabatlar. … Mahalliy hududlarga eʼtibor qaratuvchi juda tez MSA vositasi.

Bir nechta ketma-ketlikni tekislash qanday yaratiladi?

Clustal Omega algoritmi birinchi navbatda k-tuple usuli yordamida juft-juft hizalanishlarni ishlab chiqarish orqali bir nechta ketma-ketlikni tekislashni ishlab chiqaradi Keyin ketma-ketliklar mBed usuli yordamida klasterlanadi. Shundan so'ng k-o'rtacha klasterlash usuli qo'llaniladi. Yoʻl-yoʻriq daraxti keyin UPGMA usuli yordamida tuziladi.

Tavsiya: