Metagenomika atrof-muhit namunasi tarkibidagi genomlarning to'g'ridan-to'g'ri genetik tahlili sifatida aniqlanadi Bu soha dastlab atrof-muhit DNKsini klonlash bilan boshlangan, so'ngra funktsional ekspressiya skriningi [1], va keyinchalik atrof-muhit DNKsining to'g'ridan-to'g'ri tasodifiy ov miltig'i ketma-ketligi bilan tezda to'ldirildi [2, 3].
Metagenomika jarayoni nima?
Metagenomika jamoadagi barcha mikroorganizmlardan DNK olishni oʻz ichiga oladi, barcha ishtirok etgan turlarni aniqlamasdan. Genlar ketma-ketligi va aniqlangan ketma-ketliklar bilan solishtirilgandan so'ng, bu genlarning funktsiyalarini aniqlash mumkin.
Metagenomikada qanday texnikadan foydalaniladi?
Mikroblar jamoasining namunasi dengiz suvi, cho'kindi, uy hayvonlari yoki boshqa dengiz yashash joylaridan olinadi. Keyin yig'ilgan hujayralar parchalanadi va ularning lizatidan DNK olinadi. Metagenomikani imkon beruvchi texnika bu ov miltigʻi ketma-ketligi boʻlib, bu DNKning tasodifiy hududlarini maqsadsiz tarzda tartiblaydi.
Metagenomikani oʻrganish uchun 3 bosqich qanday?
Metagenomikaning bosqichlari va jarayoni:
- Toʻplam namunasi:
- DNK ekstraktsiyasi:
- Namunani tayyorlash:
- Namuna tahlili:
Funktsional metagenomika qanday amalga oshiriladi?
Funktsional metagenomika kodlangan oqsillarning funksiyalarini o'rganish uchun mikroblar jamoasidan DNKni ajratishni o'z ichiga oladi. Bu DNK fragmentlarini klonlash, surrogat xostdagi genlarni ifodalash va fermentativ faollikni tekshirishni oʻz ichiga oladi.
