Gomologik modellashtirish shablon va maqsadli ketma-ketliklar oʻrtasidagi oʻxshashlikka asoslangan maqsadli oqsilning uch oʻlchovli tuzilishini oladi va bu usul membrana oqsillarini oʻrganishda samarali ekanligini isbotlaydi. GPCR kabi kristallanish qiyin, chunki u … ni yuqori darajada tushunish imkonini beradi.
Gomologik modellashtirish nima va u nima uchun kerak?
1.2.
Gomologik modellashtirish ishonchli strukturaviy modellarni yaratish uchun eng aniq hisoblash usulidir va koʻplab biologik ilovalarda keng qoʻllaniladi. Gomologik modellashtirish shablon oqsillarini ketma-ket tekislash orqali so‘rov oqsilining 3D tuzilishini bashorat qiladi.
Gomologik Modellashtirish tamoyili nima?
Gomologik modellashtirish, shuningdek, qiyosiy modellashtirish sifatida ham tanilgan, ma'lum tuzilmalar bilan ketma-ketlik homologiyasiga asoslangan oqsil tuzilmalarini bashorat qiladi. U “ agar ikkita oqsilning ketma-ketligi yetarli darajada oʻxshash boʻlsa, ular uch oʻlchovli tuzilmalarga juda oʻxshash boʻlishi mumkin” degan tamoyilga asoslanadi.
Yaxshi homologik Modellashtirish nima qiladi?
Agar biz empirik tuzilmadan <=2 Å rmsd ga ega boʻlgan “juda muvaffaqiyatli homologiya modeli” deb taʼriflasak, shablon muvaffaqiyat uchun maqsad bilan >=60% ketma-ketlikka ega boʻlishi kerak. darajasi >70% Yuqori ketma-ketlik identifikatorlarida ham (60%-95%), har oʻn gomologik modeldan birida rmsd >5 Å vabor
Quyidagilardan qaysi biri gomologik Modellashtirishga tegishli?
Izoh: Nomidan koʻrinib turibdiki, homologiyani modellashtirish ma'lum tuzilmalar bilan ketma-ketlik homologiyasi asosida oqsil tuzilmalarini bashorat qiladi Gomologik modellashtirish shablon oqsillari bilan moslashishga asoslangan butun atom modelini ishlab chiqaradi.… Hizalash bosqichida qilingan xatolarni quyidagi modellashtirish bosqichlarida tuzatib bo‘lmaydi.
