Logo uz.boatexistence.com

Gomologik modellashtirish nima uchun muhim?

Mundarija:

Gomologik modellashtirish nima uchun muhim?
Gomologik modellashtirish nima uchun muhim?
Anonim

Gomologik modellashtirish shablon va maqsadli ketma-ketliklar oʻrtasidagi oʻxshashlikka asoslangan maqsadli oqsilning uch oʻlchovli tuzilishini oladi va bu usul membrana oqsillarini oʻrganishda samarali ekanligini isbotlaydi. GPCR kabi kristallanish qiyin, chunki u … ni yuqori darajada tushunish imkonini beradi.

Gomologik modellashtirish nima va u nima uchun kerak?

1.2.

Gomologik modellashtirish ishonchli strukturaviy modellarni yaratish uchun eng aniq hisoblash usulidir va koʻplab biologik ilovalarda keng qoʻllaniladi. Gomologik modellashtirish shablon oqsillarini ketma-ket tekislash orqali so‘rov oqsilining 3D tuzilishini bashorat qiladi.

Gomologik Modellashtirish tamoyili nima?

Gomologik modellashtirish, shuningdek, qiyosiy modellashtirish sifatida ham tanilgan, ma'lum tuzilmalar bilan ketma-ketlik homologiyasiga asoslangan oqsil tuzilmalarini bashorat qiladi. U “ agar ikkita oqsilning ketma-ketligi yetarli darajada oʻxshash boʻlsa, ular uch oʻlchovli tuzilmalarga juda oʻxshash boʻlishi mumkin” degan tamoyilga asoslanadi.

Yaxshi homologik Modellashtirish nima qiladi?

Agar biz empirik tuzilmadan <=2 Å rmsd ga ega boʻlgan “juda muvaffaqiyatli homologiya modeli” deb taʼriflasak, shablon muvaffaqiyat uchun maqsad bilan >=60% ketma-ketlikka ega boʻlishi kerak. darajasi >70% Yuqori ketma-ketlik identifikatorlarida ham (60%-95%), har oʻn gomologik modeldan birida rmsd >5 Å vabor

Quyidagilardan qaysi biri gomologik Modellashtirishga tegishli?

Izoh: Nomidan koʻrinib turibdiki, homologiyani modellashtirish ma'lum tuzilmalar bilan ketma-ketlik homologiyasi asosida oqsil tuzilmalarini bashorat qiladi Gomologik modellashtirish shablon oqsillari bilan moslashishga asoslangan butun atom modelini ishlab chiqaradi.… Hizalash bosqichida qilingan xatolarni quyidagi modellashtirish bosqichlarida tuzatib bo‘lmaydi.

Tavsiya: